Penderyn faluban, Rhondda Cynon Tafban desztillálják, a Cynon-völgyben, ahonnan a márka a nevét is kapta.
A cég 2000-ben indult Welsh Whisky Company néven. Whiskyt Walesben már több száz éve desztilláltak, de 1894-ben leállították a tevékenységet. 2004-ben indították el az értékesítést, így ez lett az első whisky, amelyet Walesben gyártottak több mint egy évszázada.
A lepárló nem whisky termékeket is gyárt: Merlyn krémlikőr, Five Vodka és Brecon Gin. A Brecon Gin 2011-ben elnyerte a “Gold Best in Class” díjat a Nemzetközi Bor- és Szeszversenyen.
A cég 2008 júniusában nyitott egy látogatóközpontot Charles, akkori walesi herceg vezetésével. A látogatóközpont ma már több mint 35 000 látogatót fogad évente.
2020 májusában jóváhagyták egy új llandudnói lepárló terveit. Az új Lloyd Street Distillery 2021. május 17-én nyílt meg, Penderyn Llandudno Lloyd St Distillery néven, az egykori Llandudno Board School, később Lloyd Street School helyén.